滴灌控制器一般有：水力直冲、水力反冲及吸力反冲几种。水力反冲为传统冲洗方式。一般认为反冲洗效果好于直冲。吸力反冲洗为近年才兴起的一种冲洗方式，效果非常好，但目前只在网式过滤器上实施。智能化灌溉
吸力冲洗网式过滤器
过滤器自动冲洗效果好。但自动冲洗的过滤器造价比手动冲洗的价格高许多。自动冲洗有压差控制及时间控制两种控制模式。压差控制比定式控制效果好。
滴灌系统可采用手动控制，半自动控制及全自动控制三种控制方式。农业滴灌常常采用手动控制及半自动控制。手动控制设备简单，可以用闸阀，球阀，蝶阀等阀门根据经验或编制好的灌溉制度实施控制。农业上手动控制十分普遍。半自动控制设备包括：定时控制器（或定量），电磁阀，电线。灌溉管理人员根据经验或编制好的灌溉制度在控制器上编程灌溉。
定时控制器
全自动灌溉系统由一台电脑控制全系统。智能化水平高，更容易做到精确灌溉，充分满足作物需水量。电脑下达命令给田间控制器。控制器启动水泵，控制阀门开启，控制过滤器冲洗，控制施肥系统施肥等。控制器上可接各种传感器，如：土壤水分传感器，土壤温度传感器，电导率传感器，ph值传感器，流量传感器，雨量传感器等，用于监测作物生长环境，自动调节。
全自动滴灌控制器是未来发展趋势。但由于设计、安装、调试、管理复杂，要求有高水平的、培训到位的优秀设计、安装、管理人员。我国现阶段在农业上不宜大规模推广。